暗影團體戰是當GO火箭隊佔領道館時會出現的一種神祕團體戰。

不同於一般的團體戰，GO火箭隊的成員會佔據道館並派遣暗影寶可夢作為團體戰頭目寶可夢。 進入道館挑戰暗影團體戰頭目寶可夢，擊敗牠們時就有機會捕捉牠們喔。 和一般的團體戰一樣，暗影團體戰會根據暗影團體戰頭目寶可夢的力量，分成不同等級。

當GO火箭隊佔領道館時，冒出紫色火焰的團體戰蛋將會出現在道館上方。 等到團體戰蛋孵化，道館在地圖上會變成黑色的。 你也可以在「附近的寶可夢」選單中看到暗影團體戰，團體戰頭目和團體戰蛋都會冒出紫色的火焰。

當你靠近被佔領的道館，GO火箭隊手下、幹部和阪木老大就會在附近出現。 點擊該道館，並使用團體戰入場券以進入團體戰。 請注意遠距團體戰入場券是不能進入暗影團體戰的。

暗影團體戰期間，暗影寶可夢可能會失控，讓牠們更難被打倒。

當暗影寶可夢進入失控狀態，如果你包包裡有淨化結晶的話，螢幕的左下方會出現按鈕。 點擊按鈕來使用淨化結晶，可以制服暗影團體戰頭目寶可夢，並且讓牠回到正常狀態。 瞭解更多關於淨化結晶的詳情。

如果你和其他訓練家成功擊敗暗影團體戰頭目，就可以獲得特殊道具，還有捕捉頭目寶可夢的機會喔。 和一般團體戰相同，會依你在團體戰的表現贈送紀念球作為獎勵。 使用紀念球來捕捉暗影寶可夢吧。