當頭目寶可夢占領道館時，便會發生團體戰。 當頭目寶可夢出現在道館時，您將有機會與其他訓練家一起挑戰頭目寶可夢。 詳情請參閱「團體戰」。
除了一般難度的團體戰外，還有決定您可能遇到的寶可夢類型的特殊團體戰，您如何參加團體戰及您可以參加團體戰的方式等。
究極異獸團體戰
在阿羅拉地區從究極空間所發現的異次元寶可夢組之一的究極異獸佔領道館前，會看見究極之洞與倒數計時出現在一起出現在道館。
究極異獸出現後，與一般團體戰一樣能進行挑戰。 請注意，究極異獸為非常強大的寶可夢，我們建議您與其他訓練家組隊一起挑戰究極異獸。
完成團體戰後，能獲得與紀念球相似的特殊精靈球「究極球」來捕捉究極異獸。 能夠獲得的究極球數取決於您造成多少的傷害以及道館是否由您的隊伍控制和您擊敗究極異獸的速度。
您可以使用樹果來讓究極異獸變得容易捕捉，但所有的究極球用完，究極異獸就會逃走。
超級團體戰
當超級進化的寶可夢占領道館時，便會發生超級團體戰。 超級團體戰是有超級進化的頭目寶可夢的困難團體戰。 擊敗了超級團體戰的頭目寶可夢將能獲得讓寶可夢超級進化所需要超級能量，並有機會捕捉此寶可夢未超級進化的形態。
超級團體戰有兩個種類：超級團體戰和超級傳說團體戰。 超級團體戰以強化的超級寶可夢為特色，而超級傳說團體戰則以更強大的超級寶可夢為特色。
詳細資訊請參閱超級團體戰
原始團體戰
原始團體戰為啟動了原始回歸的頭目寶可夢所出現的特殊團體戰。 擊敗頭目寶可夢後，將能獲得讓蓋歐卡和或固拉多變為原始蓋歐卡或原始固拉多所需要的原始能量。 也將有機會捕捉此頭目寶可夢的通常形態。
詳細資訊請參閱原始回歸。
菁英團體戰
菁英團體戰為高難度、非常強大且稀有寶可夢出現的團體戰。 由於菁英團體戰僅限在現場的訓練家能夠參加，使用遠距團體戰入場券無法挑戰菁英團體戰的頭目寶可夢。
團體戰蛋孵化後，必須在45分内挑戰頭目寶可夢。 擊敗頭目寶可夢後，與一般團體戰相同，能使用紀念球進行捕捉。
VIP 團體戰
VIP 團體戰和團體戰相似，但 VIP 團體戰需要特殊的入場券才能參加。 您必須先取得 VIP 團體戰入場劵，才能有機會捕捉最受歡迎的寶可夢。 此外，如果您獲得了一張 VIP 團體戰入場券，您可以邀請一位麻吉好朋友或正港好朋友來一起加入 VIP 團體戰。
VIP 團體戰為特別的團體戰。您有機會在獲得勝利後捕捉到最受歡迎的寶可夢。 與一般的團體戰不同，您必須先獲得邀請函，才能參加在特定的道館及特定的時間舉辦的 VIP 團體戰。 如果被選中參加 VIP 團體戰，您將會提前收到邀請函，這樣就可以事先協調和策劃如何擊敗強大的 VIP 頭目寶可夢。
如何取得 VIP 團體戰入場劵
要取得 VIP 團體戰入場劵，您必須最近曾在即將舉辦 VIP 團體戰的道館中成功地擊敗過頭目寶可夢。 如果收到 VIP 團體戰入場劵，則可以在您的包包裡找到這張附有詳細團體戰資訊的入場劵。 VIP 團體戰入場劵只能在指定的道館和邀請時間使用。
以下幾點可以增加取得 VIP 團體戰入場劵的機會:
參加更多的團體戰。 成功完成的團體戰越多，獲得 VIP 團體戰入場券的機會就越大。
為了增加機會，請試著在不同的道館團體戰中獲勝。
在 VIP 道館團體戰中贏得更高等級的道館徽章。 擁有高等級的道館徽章的訓練家，收到 VIP 團體戰邀請函的機率也將會提高。
VIP 團體戰最常於公園和贊助商道館舉行。 在道館的右上角有一個 VIP 團體戰道館 的圖示，表示該道館符合進行 VIP 團體戰的條件。
邀請朋友
當您收到 VIP 團體戰入場劵時，您可以選擇邀請一位朋友一起參加。
請注意:兒童帳戶的使用者無法使用此功能。
當您收到 VIP 團體戰入場劵時，會有一個邀請朋友的選項。 點擊 邀請。
選擇一個朋友，邀請與您一同加入 VIP 團體戰。 只能邀請友誼等級已經達到麻吉好朋友或正港好朋友的朋友一起參加。
傳送邀請後，VIP 團體戰邀請將出現在您朋友的包包中，如此一來，您和您的朋友都可以參加 VIP 團體戰。
訓練家每次只能保有一個 VIP 團體戰的邀請。 如果你收到一個朋友的邀請，在拒絕第一個邀請或 VIP 團體戰入場劵過期之前，您將無法從其他人那裡收到另一個邀請。