Eğitmenler Mega Evrimleşmiş Pokémon'ları çeşitli şekillerde kullanabilir:
 
Akın - Mega Evrimleşmiş Pokémon'lar, daha güçlü DG, saldırı, savunma ve SP'ye ek olarak Akın Maçlarında kullanıldıklarında başka özel Pokémon bonusları sunar. Mega Evrimleşen Pokémon maç alanındayken tüm Eğitmen Pokémon'larına bütün saldırıları için bir saldırı yükseltmesi verilir. Saldırı türleri Mega Evrimleşen Pokémon'unkiyle eşleşen Pokémon'lar ek bir saldırı yükseltmesi kazanır. Ancak aynı anda maç yapan birden fazla Mega Evrimleşmiş Pokémon varsa bu bonuslar üst üste eklenmez ve olası en yüksek saldırı yükseltmesi uygulanır.
 
Pokémon'larınızı Akın Lobisinden Mega Evrimleştirebilirsiniz. Akın Ekibinizde Mega Evrimleştirilebilir bir Pokémon varsa Maç Ekibinizin sol üst köşesinde Mega Evrim simgesi görüntülenir. Akın Maçı başlamadan önce Mega Evrimleştireceğiniz Pokemon'a dokunarak seçim yapın.
 
Akın Lobisinde, aktif Mega Evrimleşmiş Pokémon'u olan Eğitmenlerin avatarının yanında bir Mega simgesi bulunur ve avatarın etrafı aura ile çevrilidir:
 
Spor Salonu Maçı - Mega Evrimleşmiş Pokémon'lar ile Spor Salonlarında maç yapabilirsiniz. Ancak Pokémon'ları savunma yapmaları için Spor Salonunda bırakamayacağınızı unutmayın. Akın Maçlarına uygulanan saldırı yükseltmesi Spor Salonu maçları için de geçerlidir. Spor Salonuna bir Mega Pokémon ile saldırı yaparsanız salona aynı anda saldıran diğer Eğitmenlerin bütün saldırıları için bir yükseltme verilir. Ayrıca, saldırı türü Mega Evrimleşen Pokémon'unkiyle eşleşen Pokémon'lar ek saldırı yükseltmesi kazanır.
 
GO Roket Takımıyla Maç Yapma - Mega Evrimleşmiş Pokémon'unuzu kullanarak GO Roket Takımının serserileri veya liderleriyle (Giovanni dahil) maç yapabilirsiniz.
 
Arkadaşlarla Maç Yapma - Mega Evrimleşmiş Pokémon'unuzu kullanarak Arkadaş Listenizdeki kişilerle maç yapabilirsiniz. Ancak Mega Evrimleşmiş Pokémon, özel etkinlik kupaları haricinde GO Maç Liginde kullanılamaz.
 
Yoldaş Olma - Mega Evrimleşmiş Pokémon'unuzu aktif yoldaşınız olarak ayarlayabilirsiniz. En İyi Yoldaş olduğunuzda Mega Evrimleştirme yükseltmelerine ek olarak En İyi Yoldaş DG'si kazanırsınız.
 
GO Fotoğraf Çekme - Tıpkı normal Pokémon'larda olduğu gibi Mega Evrimleşmiş Pokémon'unuzun da GO Fotoğraflarını çekebilirsiniz.
 
Diğer Pokémon'ları Yakalama - Aktif bir Mega Evrimleşmiş Pokémon'ununuz varsa ve Mega Evrimleşmiş Pokémon ile aynı türe sahip bir Pokémon yakalarsanız ek Pokémon Şekerleri kazanabilirsiniz.