เทรนเนอร์สามารถใช้โปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้าได้หลายวิธีดังนี้:
ตีบอส - นอกจากการมี CP, พลังโจมตี, พลังป้องกัน และ HP เพิ่มขึ้นแล้ว โปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้ายังให้โบนัสพิเศษแก่โปเกมอนตัวอื่นเมื่อถูกใช้ในการตีบอส ระหว่างที่โปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้าอยู่บนสนามรบ โปเกมอนของเทรนเนอร์ทั้งหมดจะได้รับการเพิ่มพลังโจมตีทั้งหมดและได้รับการเพิ่มพลังโจมตีเพิ่มเติมหากประเภทการโจมตีของโปเกมอนนั้นๆ ตรงกับประเภทของโปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้า แต่โบนัสเหล่านี้จะไม่ซ้อนทับกันหากมีโปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้าร่วมแบตเทิลกันอยู่หลายตัวในเวลาเดียวกัน และจะใช้การเพิ่มพลังโจมตีที่สูงที่สุด
คุณสามารถวิวัฒนาการเมก้าโปเกม่อนของคุณได้จากล็อบบี้ตีบอส หากคุณมีโปเกม่อนในปาร์ตี้ตีบอสที่มีสิทธิ์วิวัฒนาการเมก้า ไอคอนวิวัฒนาการเมก้าจะปรากฏที่มุมซ้ายบนของแบตเทิลปาร์ตี้ แตะเพื่อเลือกว่าโปเกม่อนที่มีสิทธิ์ตัวไหนจะทำวิวัฒนาการเมก้าก่อนที่แบตเทิลตีบอสจะเริ่ม
ในล็อบบี้ตีบอส เทรนเนอร์ที่ใช้งานโปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้าอยู่จะมีไอคอนเมก้าอยู่ถัดจากอวาตาร์ของตนและมีออร่ารอบๆ ตัว:
ยิมแบตเทิล - คุณสามารถแบตเทิลที่ยิมด้วยโปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้าได้ แต่โปรดทราบไว้ว่าคุณไม่สามารถใช้โปเกมอนนั้นๆ เพื่อปกป้องยิมได้ การเพิ่มพลังโจมตีที่ใช้ได้ในแบตเทิลตีบอสก็ใช้ได้ในยิมแบตเทิลเช่นกัน หากคุณกำลังโจมตียิมด้วยโปเกมอนร่างเมก้า เทรนเนอร์อื่นๆ ที่กำลังโจมตียิมในเวลาเดียวกันจะได้รับการเพิ่มพลังโจมตีทั้งหมด และจะได้รับการเพิ่มพลังโจมตีเพิ่มเติมหากประเภทการโจมตีตรงกันกับประเภทของโปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้า
แบตเทิลกับแก๊งโกร็อกเกต - ใช้โปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้าเพื่อแบตเทิลกับลูกสมุนหรือหัวหน้าแก๊งโกร็อกเกต รวมถึงซากากิ
แบตเทิลกับเพื่อน - คุณสามารถแบตเทิลกับบุคคลในรายชื่อเพื่อนด้วยโปเกมอนที่วิวัฒนาการเป็นร่างเมก้าได้ แต่โปเกมอนที่วิวัฒนาการเป็นร่างเมก้าจะไม่สามารถใช้ได้ในโกแบตเทิลลีก เว้นแต่ในช่วงอีเวนต์การแข่งขันพิเศษต่างๆ
ทำให้เป็นคู่หูของคุณ - คุณสามารถตั้งโปเกมอนที่วิวัฒนาการเป็นร่างเมก้าให้เป็นคู่หูของคุณได้ หากคุณได้เป็นคู่หูมิตรแท้กันแล้ว คุณจะได้รับการเพิ่ม CP สำหรับคู่หูมิตรแท้เพิ่มเติมจากการเพิ่มพลังด้วยวิวัฒนาการเมก้า
ถ่ายโกสแนปช็อต - คุณสามารถถ่ายโกสแนปช็อตของโปเกมอนที่วิวัฒนาการเป็นร่างเมก้าได้เหมือนกับโปเกมอนทั่วไป
การจับโปเกมอนตัวอื่น - คุณสามารถได้ลูกอมสำหรับโปเกมอนเพิ่มเติมได้เมื่อคุณมีโปเกมอนที่ใช้งานการวิวัฒนาการเมก้าอยู่และคุณจับโปเกมอนประเภทเดียวกันกับโปเกมอนที่วิวัฒนาการเมก้าของคุณได้