Conforme você vai pegando mais Pokémon, é possível transferir alguns deles para o Professor Willow e liberar espaço de armazenamento. Você receberá doce em troca da transferência de um Pokémon, mas cuidado: não será possível recuperar o Pokémon depois de transferi-lo.
 
Para transferir um Pokémon:
  1. No Mapa, toque no botão Menu Principal .
  2. Toque no botão Pokémon .
  3. Selecione um Pokémon na lista.
  4. Toque no botão Menu e selecione Transferir.
Observação: não é possível transferir seu Pokémon companheiro ativo, seus Pokémon favoritos ou Pokémon que estão defendendo Ginásios.
 
Para transferir vários Pokémon de uma única vez:
  1. No Mapa, toque no botão Menu Principal .
  2. Toque no botão Pokémon .
  3. Localize o Pokémon que você gostaria de transferir. Mantenha o toque até o Pokémon ser selecionado.
  4. Toque em qualquer outro Pokémon que você gostaria de transferir. 
  5. Para transferir o Pokémon selecionado, toque no botão Transferir.
Observação: para transferir vários Pokémon lendários e míticos, primeiro você precisa ativar esta opção nas configurações do aplicativo.
   

É possível transferir vários Pokémon Brihantes, sortudos ou companheiros com os quais você alcançou o status de bom companheiro ou superior ao mesmo tempo. Além disso, alguns Pokémon Lendários e alguns Pokémons Míticos (por exemplo, Mew, Celebi) não podem ser selecionados para transferência.