트레이너는 메가 진화한 포켓몬을 다양한 용도로 사용을 할 수 있습니다.
 
레이드 참여 - CP, 공격, 방어, HP가 올라가며 메가 진화된 포켓몬을 레이드 배틀에 참여시키면 다른 포켓몬에게 스페셜 보너스를 제공 합니다. 메가 진화한 포켓몬이 배틀 자리에 있는 동안 모든 트레이너 포켓몬은 모든 공격에 대한 공격 부스트를 부여받고, 기술의 유형이 메가 진화한 포켓몬과 일치할 경우 추가 공격 부스트를 획득할 수 있습니다. 단, 여러 개의 메가 진화된 포켓몬이 동시에 싸우는 경우에는 이러한 보너스는 축적되지 않고 이용 가능한 가장 수치가 높은 어택 부스트가 적용됩니다.
 
레이드 로비에서 포켓몬을 메가진화 시킬 수 있습니다. 레이드 파티에 메가진화 가능한 포켓몬이 있다면 배틀파티 왼쪽 상단에 메가진화 아이콘이 나타납니다. 레이드 배틀 시작 전 메가진화 가능한 포켓몬을 터치하여 선택합니다.
 
레이드 로비에서, 메가 진화한 포켓몬을 보유한 트레이너는, 아바타 주위에 아우라와 메가 아이콘이 표시됩니다.
 
체육관 배틀 메가진화한 포켓몬은 체육관에서 싸울 수 있지만 체육관을 방어하기 위해 체육관에 배치할 수 없습니다. 어택 부스트는 레이드 배틀 또는 체육관 배틀에도 적용됩니다. 메가 진화 시킨 포켓몬으로 체육관 배틀하는 경우 같은 체육관에서 배틀하고 있는 트레이너 전원의 공격이 강화됩니다. 또한 메가 진화한 포켓몬의 유형에 맞는 공격을 하면 더 강한 공격을 할 수 있습니다.
 
GO로켓단과 배틀 메가 진화한 포켓몬을 사용하여 GO로켓단의 조무래기나 리더(비주기포함)와 배틀할 수 있습니다.
 
프렌드와 대전 메가진화 포켓몬으로 프렌드 리스트의 프렌드와 배틀을 할 수 있지만, 메가진화 포켓몬은 스페셜 이벤트 컵을 제외하고는 GO배틀리그에서 사용할 수 없습니다.
 
파트너 포켓몬 메가 진화한 포켓몬을 파트너로 만들 수 있습니다. 베스트 파트너라면 메가 진화의 부스트와 더불어 베스트 파트너 CP 부스트를 획득할 수 있습니다.
 
GO 스냅샷- 통상의 포켓몬과 같이 메가 진화한 포켓몬의 GO 스냅샷을 찍을 수 있습니다.
 
다른 포켓몬 잡기- 메가진화한 포켓몬이 있을 경우, 메가진화한 포켓몬과 타입이 같은 포켓몬을 잡으면 포켓몬 사탕을 추가로 획득할 수 있습니다.