トレーナーは、メガシンカしたポケモンをさまざまな用途でつかうことができます。
 
レイドに参加する -CP、アタック、ぼうぎょ、HPがあがり、メガシンカしたポケモンをレイドバトルに参加させると、他のポケモンにスペシャルボーナスを与えることができます。 メガシンカしたポケモンがバトルの場にいる間、すべてのトレーナーのポケモンはすべてのアタックに対するアタックブーストを与えられ、わざのタイプがメガシンカしたポケモンと一致する場合は、追加のアタックブーストを獲得することができます。 ただし、複数のメガシンカしたポケモンが同時に戦っている場合、これらのボーナスは蓄積されず、利用可能な最も数値の高いアタックブーストが適用されます。
 
レイドロビーからポケモンをメガシンカさせることができます。 レイドパーティにメガシンカの対象となるポケモンがいる場合、メガメガシンカのアイコンがバトルパーティの左上隅に表示されます。 レイドバトルの開始前に、メガシンカ可能なポケモンをタップして選択します。
 
レイドロビーでは、参加可能なメガシンカしたポケモンを持つトレーナーは、アバター横にメガアイコンがあり、アバターの周囲にオーラがあらわれています。
 
ジムバトルに参加する メガシンカしたポケモンはジムで戦うことができますが、ジムを防衛するためにジムに残しておくことはできません。 こうげきブーストは、レイドバトルまたはジムバトルにも適用されます。 メガポケモンでジムを攻撃しているとき、同時にジムを攻撃している他のトレーナーは、すべての攻撃力がアップし、攻撃タイプがメガシンカしたポケモンのタイプと一致すれば、さらに攻撃力がアップします。
 
GOロケット団とバトルする - メガシンカしたポケモンをバトルに参加させ、GOロケット団のしたっぱやリーダー(サカキを含む)とバトルすることができます。
 
フレンドと対戦-フレンドリストにいるフレンドと対戦する際にメガシンカしたポケモンでバトルすることはできますが、メガシンカしたポケモンは特別なイベントカップを除いて、GOバトルリーグに参加することはできません。
 
相棒にする -メガシンカしたポケモンを相棒に設定することができます。 最高の相棒なら、メガシンカのブーストに加えて、最高の相棒CPブーストを獲得できます。
 
GOスナップショットを撮る -メガシンカしたポケモンも、通常のポケモンと同じようにGOスナップショットを撮ることができます。
 
他のポケモンを捕まえる-メガシンカしたポケモンを持っていて、自分のメガシンカしたポケモンとタイプが同じポケモンを捕まえると、ポケモンのアメを追加で獲得できます。