हालांकि डायनामैक्स और जायगैंटामैक्स पोकेमॉन में कई समानताएं हैं, लेकिन कुछ ध्यान देने योग्य अंतर भी हैं.

पोकेमॉन की केवल कुछ प्रजातियां ही जायगैंटामैक्स हो सकती हैं—और उन प्रजातियों में से कुछ खास नमूने ही जायगैंटामैक्स होने में सक्षम होते हैं. ज़्यादातर पोकेमॉन डायनामैक्स होने पर अपने सामान्य रूप में ही रहेंगे.

मैक्स बैटल में जायगैंटामैक्स पोकेमॉन का सामना करना और उन्हें पकड़ना डायनामैक्स पोकेमॉन के मुकाबले और भी मुश्किल होगा. जायगैंटामैक्स पोकेमॉन के साथ मैक्स बैटल में 20 तक ट्रेनर हो सकते हैं!

हालांकि आप डायनामैक्स पोकेमॉन के खिलाफ़ मैक्स बैटल की तरह ही जायगैंटामैक्स पोकेमॉन के खिलाफ़ मैक्स बैटल में ज़्यादा से ज़्यादा 3 मैक्स पोकेमॉन ही ला सकते हैं, अगर आपके सभी पोकेमॉन गिर जाते हैं, तो बैटल खत्म होने तो उन्हें रिकवर नहीं किया जा सकेगा. इसके बजाय, आपके सभी पोकेमॉन के बेहोश हो जाने के बाद, आप अपने साथी ट्रेनर को चीयर कर सकेंगे. चीयर करने से वह आपके साथी ट्रेनर के मैक्स मीटर में जुड़ जाएगा.

जायगैंटामैक्स पोकेमॉन कैप्चर करने के बाद, आप देख सकते हैं कि अगर कुछ पोकेमॉन का इवॉल्व रूप जायगैंटामैक्ट में नहीं बदल पाता है, तो वे जायगैंटामैक्स पोकेमॉन इवॉल्व नहीं हो पा रहे हैं (जैसे जायगैंटामैक्स पिकाचू या जायगैंटामैक्स ईवी).

अंत में, हालांकि जायगैंटामैक्स पोकेमॉन को दोस्तों के साथ ट्रेड किया जा सकता है, ये ट्रेड हमेशा स्पेशल ट्रेड रहेंगे.