मेगा लेवल एक खास तरह का बोनस है जो केवल तब ही ऐक्टिव होता है जब पोकेमॉन मेगा-एवॉल्व हो जाता है. आप जितनी बार किसी खास पोकेमॉन को मेगा एवॉल्व करेंगे, मेगा लेवल उतना ही ज़्यादा होगा. मेगा एवॉल्यूशन खत्म होने पर, मेगा लेवल रीसेट भी नहीं होता है. 

हालांकि, मेगा एवॉल्व सबसे ज़्यादा मेगा लेवल, सुपर मैक्स लेवल को अनलॉक करने के लिए काफ़ी नहीं है. सुपर मैक्स लेवल को केवल पोकेमॉन की मेगा एनर्जी का इस्तेमाल करके उसे पावर देने के बाद ही अनलॉक किया जा सकता है.

आपके पोकेमॉन का मेगा लेवल जितना ज़्यादा होगा, उस पोकेमॉन के मेगा एवॉल्व होने पर उतने ज़्यादा बोनस एक्टिव होंगे. ये बोनस आपके गेमप्ले पर कई तरीकों से असर डाल सकते हैं, जैसे कि मेगा एवॉल्व वाले पोकेमॉन के समान टाइप वाले पोकेमॉन के लिए XP कैच बोनस का बढ़ना.

आप पोकेमॉन के मेगा लेवल और उस पोकेमॉन के मेगा लेवल से जुड़े बोनस को इसके पोकेमॉन जानकारी के पेज पर बने मेगा आइकन पर टैप करके देख सकते हैं.

अपने पोकेमॉन के मेगा लेवल को बढ़ाने के लिए कौन-से एक्शन लेने चाहिए और उस मेगा लेवल से जुड़े सभी बोनस के बारे में जानकारी पाने के लिए, अगले 'मेगा लेवल' आइकन पर टैप करें.