ज़्यादा पोकेमॉन पकड़ने के साथ आप अपने पोकेमॉन स्टोरेज को फ़्री करने के लिए कुछ पोकेमॉन को प्रोफ़ेसर विलो में ट्रांसफ़र कर सकते हैं. आपको पोकेमॉन ट्रांसफ़र करने के बदले में कैंडी मिलेगी लेकिन ध्यान रखें: आप पोकेमॉन ट्रांसफ़र करने के बाद उन्हें फिर से हासिल नहीं कर सकते.
 
पोकेमॉन ट्रांसफ़र करने के लिए:
  1. मैप व्यू से, मेन मेनू  बटन टैप करें.
  2. पोकेमॉन  बटन टैप करें.
  3. अपनी लिस्ट से पोकेमॉन चुनें.
  4. मेनू  बटन टैप करें और ट्रांसफ़र चुनें.
नोट: आप अपने ऐक्टिव पार्टनर पोकेमॉन, पसंदीदा पोकेमॉन या ऐसे पोकेमॉन को ट्रांसफ़र नहीं कर सकते जो फ़िलहाल जिम को डिफ़ेंड कर रहे हैं.
 
एक साथ कई पोकेमॉन ट्रांसफ़र करने के लिए:
  1. मैप व्यू से, मेन मेनू  बटन पर टैप करें.
  2. पोकेमॉन  बटन पर टैप करें.
  3. उस पोकेमॉन का पता लगाएं जिसे आप ट्रांसफ़र करना चाहते हैं. पोकेमॉन चुने जाने तक टैप और होल्ड करके रखें.
  4. किसी दूसरे पोकेमॉन पर टैप करें जिसे आप ट्रांसफ़र करना चाहते हैं.
  5. चुने गए पोकेमॉन को ट्रांसफ़र करने के लिए, ट्रांसफ़र बटन पर टैप करें.
नोट: लेजेंडरी पोकेमॉन, मिथिकल पोकेमॉन ट्रांसफ़र करने के लिए, आपको सबसे पहले अपने ऐप सेटिंग्स में इस विकल्प को चालू करना होगा.


आप एक से ज़्यादा शाइनी पोकेमॉन, लकी पोकेमॉन या पार्टनर पोकेमॉन ट्रांसफ़र कर सकते हैं जिससे आपने एक समय अच्छा पार्टनर स्टेटस या उससे बड़ा स्टेटस हासिल किया था. इसके साथ ही, कुछ लेजेंडरी और कुछ मिथिकल पोकेमॉन (जैसे म्यू, सेलेबी) को ट्रांसफ़र के लिए चुना नहीं जा सकता.