Los Entrenadores pueden usar los Pokémon megaevolucionados de muchas maneras:
Incursiones: además de haber mejorado los PC, el ataque, la defensa y los PS, los Pokémon megaevolucionados pueden dar a otros Pokémon bonus especiales cuando participen en las incursiones. Mientras un Pokémon megaevolucionado esté en el campo de batalla, los Pokémon de todos los Entrenadores mejorarán sus ataques y recibirán un aumento de ataque adicional si el tipo de su ataque coincide con los tipos del Pokémon megaevolucionado. No obstante, estos bonus no se acumularán si hay varios Pokémon megaevolucionados combatiendo a la vez y se aplicará el mayor aumento de ataque posible.
Puedes megaevolucionar a tus Pokémon desde las salas de espera de las incursiones. Si tienes un Pokémon en tu equipo de incursión que puede megaevolucionar, aparecerá el icono de megaevolución en la esquina superior izquierda del equipo de combate. Toca el icono para seleccionar el Pokémon que quieres megaevolucionar antes de que comience la incursión.
En la sala de una incursión, los Entrenadores con un Pokémon megaevolucionado activo aparecerán con un icono Mega junto a su avatar y un aura los rodeará:
Combates de Gimnasio: puedes combatir en los Gimnasios con Pokémon megaevolucionados, pero ten en cuenta que no podrás dejarlos en el Gimnasio para defenderlo. El aumento de ataque que se aplica en las incursiones también es válido en los combates de Gimnasio. Si atacas un Gimnasio con un Mega Pokémon, el resto de Entrenadores que estén atacando el Gimnasio contigo verán aumentar todos sus ataques y un aumento adicional de los tipos de ataque que coincidan con los tipos del Pokémon megaevolucionado.
Combates contra el Team GO Rocket: utiliza tus Pokémon megaevolucionados para luchar contra los Reclutas del Team GO Rocket o contra sus líderes, incluido Giovanni.
Combates con amistades: puedes enfrentarte a cualquier persona de tu lista de amigos con tu Pokémon megaevolucionado, pero los Pokémon megaevolucionados no se pueden usar en la Liga Combates GO, excepto durante las copas de eventos especiales.
Pokémon compañeros: puedes tener como compañero activo a un Pokémon megaevolucionado. Si sois mejores compañeros, ganarás un aumento de los PC como mejor compañero además del aumento por megaevolucionarlo.
Sacar una Instantánea de GO: puedes sacar Instantáneas de GO de Pokémon megaevolucionados tal y como lo harías con los Pokémon normales.
Atrapar otros Pokémon: puedes ganar más Caramelos cuanto tengas activo un Pokémon megaevolucionado y atrapes a un Pokémon que comparta tipo con tu Pokémon megaevolucionado.